Есть такая вот загадка перед человеком.
Если есть загадка, то ее надо решать, либо научными методами доказать существование души, или хотя бы каких то ее следов (например найти некое инфополе, на накопление опыта которого наши души якобы работают). Строить же теории без фактов следует оставить художественной литературе (если это конечно не теории содержащие элементы, которые можно проверить).
Да пример с кубом был не про это, а про то, что иногда внутри встроенной системы можно найти закономерности объемлющей, если хорошо поискать.
Мне кажется вы не совсем поняли мою аналогию. Человек сидящий в кубе может создать миллионы теорий почему одна грань притягивает его, а другие нет, притом среди этого миллиона может быть и теория что у него есть душа, которая тянется в ту сторону (или к той грани), а может среди этого миллиона промелькнет и настоящая — о наличии гравитации.
Но что есть материя?
Мы не знаем, что есть материя на микро-уровне, зато знаем, что она несть на макроуровне. Вы сами поминали бездушный и простой камень, состоящий из сложных атомов.
В одной художественной книге была достаточно любопытная теория, что есть множество информационных полей (которые для простоты можно назвать аурами), и их фокусировка в одной точке есть текущая реальность и текущий человек. Но все это любопытные гипотезы и теории, фактов то нет.

