Geksor, сначала учет ведется по каждому счету отдельно, потом фин результаты сальдируются. Купоны, пришедшие вне ИИС (на банковский счет), сальдируются с прибылью/убытками на обычном брокерском счете.

Прямым текстом в НК нигде не прописано. Но логически, если выплата пришла на ИИС — это доход ИИС, если на другой счет — это уже доход не ИИС и под льготы не попадает.

Если бы это был доход ИИС, брокеры его бы отражали в расчете налоговой базы счета ИИС.