На сайте comon указана как 38.46% от суммы всей комиссии, уплаченной пользователем.
Кроме того, встречал такие разъяснения от А.Г.:

1. — вознаграждение составляет 50% от комиссии комона минус 26% соцналог, минус 13% НДФЛ;
2. На комоне совсем разные комиссии, в том числе и от прибыли и вообще выбор своей части комиссии за автором. Комиссия чисто комона: 1% от СЧА на стратегиях на ОФЗ, 2% на ОФЗ и других инструментах и 3% на стратегиях без ОФЗ. Остальное определяет автор. А 6% годовых просто устанавливается при создании стратегии, потом автор свою часть волен изменить как хочет.

Кто-нибудь, кто в этом разбирается, расскажите как это работает.