Не уйдет.
По фьючерсу суммарно получите точно разницу между ценой продажи и ценой экспирации. Минус комиссия за сделку (только за одну) и комиссия за экспирацию (только за одну).
Все, что начислено промежуточно (вариационная маржа) общий результат не изменяет. Это лишь промежуточные итоги, важные для отслеживания не ушли ли вы в минус.
Риск тем не менее есть, будучи суммарно по акции и фьючерсу в плюсе, по иметь на фьючерсе большую отрицательную вар маржу и может не хватить денег на ГО, тогда брокер вас закроет по маржинколу. Следите, чтобы хватало средств на срочке.
Возможно выгоднее будет вблизи экспирации закрыть позиции, не дожидаясь поставки.