Основные обвинения в адрес Франкла были выдвинуты историком Тимоти Пайтеллом (Timothy Pytell) в его книге 2005 года. Согласно этой версии:

• Работа в нацистских структурах: Логотерапия (метод Франкла) развивалась под эгидой нацистского Института Геринга в 1930-х годах. Также Франкл работал в Ротшильдской больнице, которая контролировалась нацистами, где проводил «сомнительные медицинские эксперименты» над евреями, пытавшимися покончить с собой, чтобы избежать депортации.

• Преуменьшение своего опыта: Пайтелл утверждает, что Франкл провел в Освенциме всего несколько дней (а не длительное время), что ставит под сомнение его образ «героического выжившего».

• Послевоенное поведение: Критике подвергались его послевоенные связи с политиками, имевшими неоднозначное прошлое, и его роль в формировании «неоднозначного» австрийского взгляда на историю.

• Вопрос о сотрудничестве Виктора Франкла с нацистами является предметом острых исторических дебатов. Обвинения в коллаборационизме были выдвинуты, но они не являются общепризнанными и встречают серьезный отпор со стороны других исследователей, которые располагают документальными свидетельствами, представляющими Франкла как жертву и противника нацистского режима.