ЕСН, Основу диаграммы делаю в опенсорсном проекте SankeyMATIC. Перед этим обрабатываю данные в Excel. Финальный вариант доделываю уже в других графических редакторах.
Из интересного еще есть SankeyArt, но он ограничен без подписки и не такой гибкий по функционалу, а из плюсов зато сразу неплохие диаграммы показывает. Кстати, на их сайте можно посмотреть некоторые диаграммы по зарубежным компаниям.
Другие варианты: расширения для Excel, через Google charts, plotly на Python — не особо зашли