Один знакомый трейдер сказал, что положительная вариационная маржа в ЕС для гражданина ЕС не налогооблагается 

Я не в курсе, может и так, может CBOE для иностранцев сразу списывает налог🤷‍♂️

Или где почитать?

От чего зависеть может: от гражданства, налоговой резиденции, резиденции биржи?