Сколько инструментов должно быть в алго-портфеле?

От разных факторов зависит. Я ещё и акции торгую — акций больше — торгую больше инструментов).

На FX — любое количество инструментов, к которым удалось подобрать ключик. Ликвидности хватает.

Наверное, важно еще учитывать корреляцию между инструментами. Для чего набирают много инструментов — чтобы диверсифицировать торговлю, когда один инструмент выбился из системы, другой продолжает приносить результат. А если например, взяли 40 инструментов и из них 30 высококоррелированных между собой, тогда какой смысл.

главное волатильность, а не как БСП, Ростело и пр стоят годами в диапазоне
ну и ликвидность конечно же

Я торгую 171 акцию на данный момент. 
Есть несколько соображений, почему полезно добавлять больше инструментов:
— текущая средняя корреляция между этими акциями около 0,065, а это значит, что нехило можно снизить риски и для полной реализации потенциала снижения риска 4 бумаг будет недостаточно
— больше бумаг, меньше на каждую приходится активов и вас меньше беспокоит ликвидность
— больше бумаг чаще возникают сигналы, вы можете выбирать самые сильные и за счет этого частично жертвовать большим проскальзованием на менее ликвидных бумагах