Налоговая и Interactive Brokers

Каждый выбирает для себя.

Подтверждение от брокера об открытии им счета нужно банку для валютного контроля, который осуществляется центробанком. Насколько ЦБ делится данными ФНС — это уже вопрос взаимодействия органов власти (которое может меняться).

Отчитаться в ФНС о брокерском счете в IB вы пока не можете (форм еще нет). В 2020 отчитываться надо будет, если откроете счет в том же году (об открытых ранее подавать уведомление об открытии, вроде, не надо, отчитываться о движении за 2019 тоже). О движении средств за 2020 отчет подается в 2021.

Ну и, наконец, отвечая на вопрос из поста: декларировать доходы в 3-НДФЛ и уплачивать 3% разницы (если подписана форма W8-BEN и налог в США с дивидендов берется 10%-ный) обязанность есть.
Ну и, да, подача 3-НДФЛ (с последующей уплатой налога) и отчетность об открытии/закрытии/движении средств — это две разных процедуры (одна не исключает другую) и вторая, собственно, с 2020 года добавляется к первой (которая всегда была обязательной).

Уплата налога и уведомление ФНС об открытии счета никак не связаны.
Имейте ввиду скоро заработает обмен между IB и ФНС. Если не платили налоги придется несладко.
Уведомлять об открытии счета в IB нужно было еще с 2016 года, но это уже совсем другая история… о ней я надеюсь напишу завтра.
https://right-ways.ru/stati/129-nalogovaya-kosultaciya

Ну и где там об обмене с IB ? 
Ресурс очередная помойка.  Я знаю, что вы, в отличии от подавляющего числа здешних писателей, являетесь практикующим трейдером и адекватным человеком.
Но в последнее время вы принимаете странные и поспешные решения — например заявили в налоговую о том, для чего еще и функционал у них не готов. Сейчас утверждаете то, чего нет. 
Автообмен начался, но по линии банков. Все!  На сегодня по остальным вопросам, есть только естественные хотелки   нашей налоговой, не более.
Нигде нет информации о том, что американские брокеры обмениваются, или собираются что то передавать в РФ.

Биотехнолог, вы сами дали ФНС карты в руки, отчитавшись о счете в IB как о банковском (коим он не является). Ну а теперь-то они вас, ясное дело, не отпускают. Чистосердечное признание у них в виде отчета от вас есть, у ФНС от него никаких проблем нет: им до лампочки сейчас банк IB или не банк по американским законам, бумажка у них имеется, и теперь ваша очередь бегать и доказывать, что не верблюд.
Выдержка из письма, которое вы цитируете постоянно, касается брокерских счетов в _банках_ (и закон, действительно, не уточняет по каким типам счетов в банках надо отчитываться, из чего вытекает, что по всем). Но суть-то не в типе счета, а в типе организации, в которой счет открыт, а этот аспект ФНС в своем письме тактично обошли.