НДФЛ считается по всем рынкам или каждому в отдельности?

не сальдируется

акции и фьючерсы на акции сальдируются

Если акции только купите, то с плюса на срочке возьмут налог. А если один раз продадите в конце декабря и откупите, то финрез по ценам продажи на акциях просальдируется с суммарной вармаржой на фьючерсах по итогам всего года.

В течении календарного года никакого сальдирования не производится, только по концу года (в январе следующего)  сальдруется и можно вернуть излишне удержанный налог.

Это если инструменты на срочном рынке — акции или фондовые индексы. А сальдирование по итогам года хитрее. Если операции только на организованном рынке, то считаются три результата:
1. Налогоблагаемая база  от операций на рынке ценных бумаг
 2. Налогоблагаемая база от операций на рынке производных финансовых инструментов, базовыми активами которых являются ценные бумаги или фондовые индексы.
3. Налогоблагаемая база от операций на рынке производных финансовых инструментов, базовыми активами которых НЕ являются ценные бумаги или фондовые индексы.

Далее в пользу клиента можно просальдировать  или 1+2 или 2+3 по принципу: если  больше нуля, то берем сумму, если меньше либо равно нулю, то нуль.

И эту цифру сложить с неучаствовавшей в сальдировании, преобразованной по тому же «принципу»: если больше нуля, то сама цифра, если меньше либо равна нулю то нуль.

Кроме того, если 1 меньше нуля и 1+2 меньше нуля, то этот убыток можно перенести на будущие периоды и просальдировать с будущими положительными результатами на 1.

Это разные счета. Не сальдируются доходы/расходы.
Вы если решили торговать, то лучше изучите материал из профильных сайтов или книг. На форуме вы можете не найти правды.
Надеюсь, что вы пока не открыли счёт.