Как правильно определить цену Si через цену USDTOM. Подгонка через своп TODTOM и количеству дней до исполнения не подходит. Через что ещё можно объяснить цену фьючерса?

Открываем Буренина, находим там формулу фьючерса. Все.

Ну, там как бы идея в том, что когда Вы покупаете фьючерс на доллар за рубли, то Вы как бы занимаете рубли в объёме контракта фьючерса. И кладёте на депозит доллар. За заём и за размещение денежных средств платятся проценты по безрисковой ставке. Соответственно, так как Вы взяли в кредит рубли, то Вы платите за кредит по рублёвой безрисковой ставке; так как Вы разместили на депозит доллары, то Вам платят за депозит по долларовой безрисковой ставке.

В рублях за безрисковую ставку можно принять ставку, по которой банки России выдают друг другу кредиты/принимают депозиты. Это может быть либо RUONIA (около 8% сейчас), либо ключевая ставка (8.5%). В долларах за безрисковую ставку обычно принимают LIBOR (вроде сейчас это около 1%). Тогда разницу между расчётной ценой фьючерса и ценой базового актива можно прикинуть по формуле:
цена_базового_актива*(0.08-0.01)*количество_дней_до_экспирации/365.

То есть, по фьючерсу на доллар имеем среднее контанго около 7% годовых, что, кстати, видно на этой странице:
smart-lab.ru/q/futures/

Если по базовому активу платится дивиденд, то его нужно вычесть. По этой причине, например, контанго по фьючерсу на индекс ММВБ — меньше, чем контанго фьючерса на доллар.

Но к этому ещё важно прибавить ожидания рынка. Если рынок ждёт, что будет падать, то цена фьючерса будет меньше расчётной. Если ждёт, что будет расти, то цена будет больше. И отклонения из-за ожиданий могут быть довольно-таки существенные.

 Автор, на мой взгляд, у вас где-о ошибка в расчетах.