На ЕБС куплены доллары, захеджированные проданными фьючерсами на доллар. Будет ли взиматься какая-нибудь комиссия или проценты за то, что для ГО используются доллары? Брокер Открытие.

Не будет, если стоимость активов больше гарантийного требования 

Rostislav Kudryashov, проверено. В Открытии доллары могут служить ГО, никаких процентов не берут

Если у Вас под ГО используются доллары, то да будет комиссия, если позицию на фьючерсах будете переносить через 19:00(внутри дня это бесплатно) это касается ЕБС. Но если у Вас был бы обычный брокерский счет, не ЕБС то там это абсолютно бесплатно(хоть с переносом через ночь, хоть внутри дня). Чтобы отказаться от ЕБС в открытие брокер потребуется закрытие счета и открытие его по новой, второй счет они не открывают.
Но лучше Вам уточнить у брокера, так было раньше. Может сейчас что изменилось.

А как они могут не брать проценты? Например, у Вас на срочке 1000 долларов (текущая цена 62000 допустим) и 10000 руб. Допустим, брокер пересчитал баксы под го по 55 руб за доллар, итого, го = 65000 руб. Вы продали фьюч si за 64000 руб. И фьючерс вырос на 20000 руб. В итоге, у Вас по si убыток 20000 руб (брокер за Вас отдал Вашему контрагенту 20000 руб.)плюс го нужно под фьючерс. То есть по рублям у Вас вместо +10000 руб вначале, стало — 10000руб за счёт списания вармаржи и отдал её брокер из своих денег (доллары же он Ваши не продавал). Поэтому проценты будут списывать по любому за пользование деньгами (вроде стало или станет 19% годовых, вместо 24% у Открытия)