Список проголосовавших за комментарий "shprots, есть минус — R всё же однопоточный как ни крути. Поэтому связка возможна только в 2-х вариантах — либо собственные скрипты на R максимально распараллелены (что порой крайне непросто), либо R.NET (пока что знаю только этот мостик между R и .NET, лучше не встречал) враппится через интерсептор и эмулируется мультиинстанс R.NET через прокси. Но это непросто, сам как-то писал код подобный, много ньюансов."