Юрген фон Фаренсбах родился в 1551 г., происходил из древнего немецкого рода, один из представителей которого в XIV в. обосновался на землях Ливонии. Юрген был одним из сыновей ливонского феодала средней руки Вольмара фон Фаренсбаха.
В 1565 году отец посчитал его достаточно взрослым и отправил в соседнюю Швецию — обучаться военному делу. В те годы Швеция вела войну против Дании, Польши и Любека. В одном из сражений Юрген попал в плен к датчанам, но вскоре бежал и отправился во Францию.
Поучаствовав в кровавой гражданской войне между католиками и гугенотами, Юрген через год уехал в Австрию, где император Максимилиан II вёл жестокую войну с турками. После того как Австрия заключила мир с Османской империей, Юрген в 1570 г. вернулся на родину, где была в разгаре Ливонская война.